В настоящее время экономика стремительно трансформируется, переходя к информационно-инновационной модели. Данный переход сопровождается глубокими изменениями в подходах к управлению экономической деятельностью с акцентом на формировании стратегического инновационного потенциала. Цель исследования – разработка и обоснование методики оценки инновационного потенциала кластерных структур, а также проверка возможностей ее практического использования. Методологической основой данной работы стал комплексный междисциплинарный подход, позволивший разработать методику, которая является системной платформой, созданной для эффективной адаптации инновационной деятельности к изменяющимся условиям внешней экономической среды на основании получения стратегически значимой аналитической информации. Она включает методику экспертного опроса и методику экономико-математического моделирования, которые в совокупности образуют интегративную модель аналитического стратегирования инновационного развития, охватывающую качественные оценки в сочетании с количественными прогнозными расчетами, что создает предпосылки для выработки стратегических решений на уровне кластерной политики. Материалом для проведения исследования стали эмпирические данные, полученные в ходе апробации методики. Результаты исследования могут быть использованы в процессе оценки инновационного потенциала кластерных структур в условиях стратегического планирования и стратегического управления инновационными кластерами. Предлагаемый подход адекватно описывает инновационный потенциал кластерных структур, что позволяет рекомендовать его к практическому использованию в области финансово-экономической и организационно-стратегической аналитики, связанной с деятельностью кластерных инновационных объединений.